實現對系統中的信息包進行數字簽名，保證數據的完整性和不可抵賴性，其子功能包括針對字段的電子簽名和針對 XML 的電子簽名。加密的數據包括電子健康信息(使用個人、醫師或醫療機構密鑰)等信息。劉凌151,0278,8921
通過訪問權限管理、數據加密等多種安全手段，在保證健康檔案（含電子病歷）共享的同時實現對居民隱私的保護。提供單點登錄、授權、認證、基于角色的訪問、數據庫高級安全、應用流程控制等。病人同意原則：強調居民/病人權利，居民健康信息授權使用。匿名化：用于分析研究時隱去不必要的人員基本信息。居民個人隱私診斷信息隱藏，如艾滋病、精神疾病等。
電子認證的核心技術是基于數字證書的數字簽名技術，數字證書是由權威公正的第三方機構即CA中心簽發的，用于標識網絡用戶身份信息的一系列數據，用來在網絡通訊中識別通訊各方的身份，即要在Internet上解決“我是誰”的問題，就如同現實中我們每一個人、每個單位都要擁有一張（或幾張）證明身份、資質，資格的證件一樣，以表明我們的身份或某種資格。以數字證書為核心的加密技術，還可對網絡上傳輸的信息進行加密和解密，數字簽名及驗簽，確保網上傳遞信息的機密性、完整性，以及用戶身份的真實性，簽名信息的不可否認性，從而保障全民健康信息平臺系統的網絡應用安全。
